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時(shí)空組學(xué)

高通量測(cè)序技術(shù)助力
時(shí)空組學(xué)的研究與應(yīng)用

Applications

隨著生命科學(xué)研究的日益深入,傳統(tǒng)的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)已難以滿足對(duì)深層次、多維度生命系統(tǒng)探索的需求。時(shí)空組學(xué)技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,成為細(xì)胞研究領(lǐng)域的新星,它融合時(shí)間與空間維度,精準(zhǔn)捕捉細(xì)胞基因表達(dá)及其在組織中的動(dòng)態(tài)交互,革新了我們對(duì)生命奧秘的理解。

華大作為生命科學(xué)前沿技術(shù)的主要推動(dòng)者,在2020年年初發(fā)布了自主研發(fā)的時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq(Spatial Enhanced Resolution Omics-Sequencing),該技術(shù)憑借高分辨、大視場(chǎng)、多組學(xué)、全物種的優(yōu)勢(shì),已成功應(yīng)用于胚胎發(fā)育、疾病病理、腫瘤學(xué)、腦科學(xué)、植物科學(xué)等領(lǐng)域,助力科研人員在Cell、Science、Nature等國(guó)際頂級(jí)期刊上發(fā)表了多項(xiàng)科研成果。

時(shí)空組學(xué)

時(shí)空組學(xué)產(chǎn)品方案

產(chǎn)品方案對(duì)比

時(shí)空轉(zhuǎn)錄組FF產(chǎn)品方案(V1.3)

時(shí)空轉(zhuǎn)錄組FF V1.3 兼容mIF產(chǎn)品方案

時(shí)空轉(zhuǎn)錄組FFPE產(chǎn)品方案

時(shí)空轉(zhuǎn)錄組大尺寸芯片產(chǎn)品方案

時(shí)空蛋白轉(zhuǎn)錄組Stereo-CITE產(chǎn)品方案 V1.1

產(chǎn)品方案對(duì)比

類別時(shí)空轉(zhuǎn)錄組時(shí)空多組學(xué)
產(chǎn)品方案時(shí)空轉(zhuǎn)錄FF時(shí)空轉(zhuǎn)錄組FFPE時(shí)空轉(zhuǎn)錄組大尺寸芯片時(shí)空蛋白轉(zhuǎn)錄組Stereo-CITE
捕獲原理樣本類型Poly-A 捕獲隨機(jī)探針捕獲Poly-A 捕獲Poly-A 捕獲
檢測(cè)組學(xué)信息RNARNARNARNA+蛋白

檢測(cè)樣本類型

Fresh FrozenFFPEFresh FrozenFresh Frozen

兼容染色方案

SSDNA染色、

H&E染色、

mIF染色(適用于1cm x 1cm)

ssDNA染色、

H&E染色

ssDNA染色、

H&E染色

DAPI染色
捕獲面積

0.5 cm x 0.5 cm、

1 cm x 1 cm

1 cm x 1 cm

1 cm x 2 cm、

2 cm x 2cm、

2 cm x 3 cm可定制尺寸,最大到13 cm x 13 cm

1 cm x 1 cm
檢測(cè)物種類型不限物種不限物種不限物種人、小鼠
擴(kuò)展應(yīng)用

轉(zhuǎn)錄組兼容組織形態(tài)學(xué);

轉(zhuǎn)錄組兼容低通量蛋自檢測(cè);

空間單細(xì)胞分析

轉(zhuǎn)錄組兼容組織形態(tài)學(xué);

微生物共檢測(cè);

非編碼RNA共捕獲;

空間單細(xì)胞分析

定制化尺寸、

空間單細(xì)胞分析

轉(zhuǎn)錄組兼容高通量蛋白檢測(cè)
分析軟件版本SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1SAW v8.1、StereoMap v4.1

SAW v8.1、StereoMap v4.1

Stereo-seq時(shí)空組學(xué)技術(shù)

時(shí)空組學(xué)技術(shù)Stereo-seq(SpaTial Enhanced REsolution Omics-sequencing),基于DNA納米球(DNA Nano Ball,DNB)開發(fā),是具有高通量、超高分辨率、大視場(chǎng)的原位全景式技術(shù),可以實(shí)現(xiàn)同一樣本在組織、細(xì)胞、亞細(xì)胞、分子“四尺度”同時(shí)進(jìn)行空間轉(zhuǎn)錄組分析。該技術(shù)通過時(shí)空芯片捕獲組織中的 mRNA,并通過時(shí)空條形碼(Coordinate ID,CID)還原回空間位置,實(shí)現(xiàn)組織中基因空間表達(dá)檢測(cè),為深入地了解細(xì)胞的基因表達(dá)及形態(tài)與局部環(huán)境之間的關(guān)系建立強(qiáng)大的研究基礎(chǔ)。

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