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發(fā)布時間：2023.09.20
作者：華大智造
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9月15日，國家衛(wèi)生健康委員會發(fā)布公告稱，考慮到猴痘疫情將在我國一定時期內(nèi)持續(xù)存在，為進(jìn)一步科學(xué)規(guī)范開展猴痘疫情防控工作，切實(shí)保障人民群眾生命安全和身體健康，國家衛(wèi)生健康委決定，自2023年9月20日起將猴痘納入《中華人民共和國傳染病防治法》規(guī)定的乙類傳染病進(jìn)行管理，采取乙類傳染病的預(yù)防、控制措施。
根據(jù)中國疾控中心公布的數(shù)據(jù)，3個月內(nèi)，中國內(nèi)地本土猴痘病例累計(jì)已經(jīng)超過千例。《中華人民共和國傳染病防治法》規(guī)定，疾病預(yù)防控制機(jī)構(gòu)應(yīng)當(dāng)主動收集、分析、調(diào)查、核實(shí)傳染病疫情信息，接到乙類傳染病疫情報(bào)告或者發(fā)現(xiàn)傳染病暴發(fā)、流行時，應(yīng)當(dāng)立即報(bào)告當(dāng)?shù)匦l(wèi)生行政部門，由當(dāng)?shù)匦l(wèi)生行政部門立即報(bào)告當(dāng)?shù)厝嗣裾瑫r報(bào)告上級衛(wèi)生行政部門和國務(wù)院衛(wèi)生行政部門。
為了助力疾控系統(tǒng)提升應(yīng)急溯源能力，華大智造已經(jīng)為各級疾控中心提供了可實(shí)現(xiàn)猴痘病毒快速鑒定及溯源的病原微生物靶向測序產(chǎn)品組合，相關(guān)設(shè)備及產(chǎn)品已投入運(yùn)營。
內(nèi)地首例后，華大智造再助力深圳疾控
完成深圳首例猴痘病例病毒溯源
今年6月，深圳市疾病預(yù)防控制中心（簡稱深圳疾控）基于華大智造病原微生物靶向測序產(chǎn)品組合完成深圳首例猴痘病例病毒溯源，相關(guān)文章被Biosafety and Health雜志接收并于8月發(fā)表。
截圖自Biosafety and Health雜志
6月8日22時整，深圳市疾病預(yù)防控制中心接到福田區(qū)疾控中心通報(bào)的一例猴痘疑似病例，并立即抽調(diào)人員開展流行病學(xué)調(diào)查，收集了大量樣本用于猴痘病毒的分子檢測和病毒測序。
該次溯源采用華大智造ATOPlex多重PCR技術(shù)開發(fā)的猴痘病毒靶向測序Panel對猴痘病毒基因組富集及測序文庫的構(gòu)建，建庫流程搭配了MGISP-960高通量自動化樣本制備系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)了高效自動的實(shí)驗(yàn)流程。使用一步法制備DNA 納米球 (DNB)，而后在DNBSEQ-G99測序儀上對 DNB 文庫進(jìn)行測序，并使用華大智造MPXV軟件包對測序數(shù)據(jù)進(jìn)行了分析，從而確定突變位點(diǎn)、共有序列和猴痘病毒譜系，最終在短時間內(nèi)得到了高度可信的毒株序列全長。
研究人員通過基因組測序的Nextclade分析（https://clades.nextstrain.org/），確定了深圳三例病例均感染了人類猴痘病毒（hMpxV，B.1.3進(jìn)化分支）。對已識別的猴痘病毒進(jìn)行進(jìn)一步的溯源研究，研究人員對全球所有B.1.3基因序列進(jìn)行了系統(tǒng)發(fā)育樹分析，發(fā)現(xiàn)深圳和杭州的四個本地病例與最近許多日本猴痘病例處于同一進(jìn)化分支上。從進(jìn)化的角度來看，這四個中國病例與2023年1月、2月和3月收集的日本株系（GISAID ID: EPI_ISL_17445514，EPI_ISL_17445515，EPI_ISL_17692269）高度同源。
中國深圳發(fā)現(xiàn)的3個MPXV的系統(tǒng)發(fā)育樹，45個MPXV（樣本采集時間為2023年1月1日至2023年7月3日）下載于GISAID
快速、精準(zhǔn)，華大智造病原微生物靶向測序產(chǎn)品組合
為猴痘監(jiān)測“一錘定音”
此前，華大智造于2022年9月助力中國疾控中心完成內(nèi)地首例輸入性猴痘病例病毒溯源，該次溯源基于華大智造當(dāng)時剛發(fā)布的最新款基因測序儀DNBSEQ-G99等設(shè)備進(jìn)行全基因組測序，在短時間內(nèi)得到了高度可信的毒株序列全長。
為進(jìn)一步提升猴痘病毒溯源工作的效率，華大智造推出病原微生物靶向測序產(chǎn)品組合，基于ATOPlex多重PCR技術(shù)開發(fā)了猴痘病毒靶向測序Panel，含739重PCR引物，覆蓋病毒全長基因組，可對病毒進(jìn)行相對定量，搭配華大智造DNBSEQ測序平臺和MPXV分析軟件以及MGISP-100或MGISP-960高通量自動化樣本制備系統(tǒng)，實(shí)現(xiàn)從樣本到報(bào)告的全流程支持，具有數(shù)據(jù)質(zhì)量優(yōu)異、基因組覆蓋全、自動化程度高等特點(diǎn)，為猴痘病毒的監(jiān)測與溯源提供強(qiáng)大工具。
ATOPlex多重PCR 技術(shù)，是華大智造自主研發(fā)的超高重 PCR 核心專利技術(shù)，可針對目標(biāo)區(qū)域進(jìn)行引物設(shè)計(jì)，并提供Panel和建庫試劑等一整套方案，實(shí)現(xiàn)精準(zhǔn)高效的病原微生物靶向測序。除此之外，該技術(shù)平臺還可應(yīng)用于司法、農(nóng)業(yè)、腫瘤等多個領(lǐng)域，提供全面、專業(yè)的靶向測序產(chǎn)品。
華大智造病原微生物靶向測序產(chǎn)品組合
華大智造設(shè)備與軟件在猴痘病毒監(jiān)測應(yīng)用中已經(jīng)積累了一定的實(shí)踐基礎(chǔ)，成功助力中國疾控中心、地方疾控等多個公共衛(wèi)生機(jī)構(gòu)對猴痘病毒進(jìn)行病毒識別與溯源。面對不斷產(chǎn)生的疫情挑戰(zhàn)，華大智造始終秉承“創(chuàng)新智造引領(lǐng)生命科技”的理念，持續(xù)提升技術(shù)平臺和核心產(chǎn)品，致力于滿足病原微生物全基因組測序、靶向測序和宏基因組測序全流程等應(yīng)用場景的需求，為傳感染病的監(jiān)測和預(yù)警提供更自動、更便捷、更高效的核心工具。
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